W ostatnich latach bardzo rozwinęły się możliwości zabiegowe w trakcie gastroskopii, do których między innymi zalicza się:

• wcześniej opisane pobieranie wycinków i usunięcie polipów (polipektomia);
• hamowanie krwawień – krwawienia z żylaków przełyku lub powstałych np. jako powikłanie choroby wrzodowej;
• usuwanie połkniętych ciał obcych;
• leczenie powstałych zwężeń i blizn;
• usuwanie kamieni z dróg żółciowych (w dwunastnicy znajduje się ujście dróg żółciowych).

Możliwe powikłania po gastroskopii

Powikłania po zabiegu występują wyjątkowo rzadko, należą do nich: przebicie przewodu pokarmowego, zapalenie śródpiersia, krwawienia niemożliwe do zatrzymania, zaostrzenie choroby niedokrwiennej serca.
Sprzęt do gastroskopii jest za każdym razem dezynfekowany, ponadto w wielu pracowniach do badania wymagany jest od pacjentów aktualny wynik badania w kierunku wirusów zapaleń wątroby. Należy pamiętać, aby badanie wykonywać w renomowanej pracowni, w których badania przeprowadzają lekarze posiadający odpowiedni certyfikat (Certyfikat wydany przez Zarząd Sekcji Chirurgii Endoskopowej Towarzystwa Chirurgów Polskich). Można być wówczas pewnym prawidłowej diagnozy.