Częściej do powstania IUGR dochodzi w ciążach wielopłodowych; wystąpienie ciąży bliźniaczej zwiększa prawdopodobieństwo powstania IUGR ponad 5-krotnie. Bardzo niekorzystnie na rozwój płodu wpływa spożywanie przez matkę alkoholu w czasie ciąży. Jego negatywne działanie polega na zmniejszeniu transportu przez łożysko wielu substancji odżywczych: aminokwasów, glukozy, witamin, cynku, żelaza. Alkohol powoduje, że wątroba płodu ma upośledzoną zdolność do wytwarzania glukozy i białek, a naczynia krwionośne ulegają nieprawidłowemu obkurczeniu zaburzając transport tlenu i niezbędnych związków.

W ciąży bardzo groźne w skutkach mogą być zakażenia u matki, takie jak: różyczka, cytomegalia, opryszczka, ospa wietrzna, WZW typu B, toksoplazmoza, kiła oraz inne infekcje bakteryjne. Dostrzega się też zależność pomiędzy wzrostem matki a niską masą urodzeniową dziecka. Szczególnie zaznaczone jest to przy wzroście matki poniżej 146 cm. Zależność ta dotyczy także masy ciała kobiety ciężarnej; im mniejsza waga kobiety przed ciążą oraz im mniejszy przyrost jej wagi w trakcie ciąży, tym większe prawdopodobieństwo urodzenia dziecka z hipotrofią.

Przyczyny łożyskowe hipotrofii to te, które będą prowadzić do zaburzenia ukrwienia płodu, z powodu nieprawidłowej budowy łożyska. Do takiego stanu może prowadzić nadciśnienie kobiet w ciąży. Dochodzi wówczas to powstania patologicznych połączeń naczyniowych w obrębie łożyska, co skutkuje niedotlenieniem i niedożywieniem, a w konsekwencji hipotrofią i zagrożeniem życia płodu. Występowanie łożyska przodującego i przedwczesnego odklejenia się łożyska również wiążę się z częstszym występowaniem hipotrofii.